امام خمینی (س) بر اساس وظایف و اختیارات خود و پس از محرز شدن بیکفایتی ابوالحسن بنی صدر برای فرماندهی نیروهای مسلح، در بیستم خرداد ماه سال ۶۰، وی را از این سمت برکنار کرد. متن حکم امام به شرح زیر است: